More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1447 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 914 aa  1855    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  56.63 
 
 		 903 aa  934    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  57.28 
 
 		 941 aa  1027    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  51.04 
 
 		 935 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  96.5 
 
 		 913 aa  1729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  57.08 
 
 		 941 aa  1029    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  77.16 
 
 		 906 aa  1420    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  77.16 
 
 		 906 aa  1416    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  77.16 
 
 		 906 aa  1420    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  57.08 
 
 		 941 aa  1029    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  50.48 
 
 		 893 aa  829    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 879 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 874 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.34 
 
 		 827 aa  333  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 927 aa  298  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 928 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 852 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 884 aa  277  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 948 aa  277  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 861 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 861 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 861 aa  273  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 849 aa  271  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  27.94 
 
 		 880 aa  265  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 901 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 861 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 861 aa  261  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.45 
 
 		 834 aa  261  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 944 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 871 aa  258  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.24 
 
 		 877 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 869 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 904 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 855 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 857 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 891 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 875 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 847 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 953 aa  238  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1001 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 950 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 890 aa  227  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.9 
 
 		 866 aa  227  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 890 aa  225  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 890 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 909 aa  222  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 854 aa  219  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1064 aa  218  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 867 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 886 aa  217  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 886 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 882 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 867 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 868 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 867 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 909 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 882 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 892 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 867 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 843 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 896 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 910 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1055 aa  207  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 872 aa  202  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 866 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 869 aa  201  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 894 aa  201  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 817 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 841 aa  197  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 956 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 894 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 930 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 930 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 930 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.96 
 
 		 853 aa  194  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 869 aa  194  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 876 aa  194  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 1006 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.47 
 
 		 839 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 991 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 896 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 873 aa  188  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 908 aa  187  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 901 aa  186  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 855 aa  186  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 966 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 855 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  25 
 
 		 922 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 925 aa  183  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 924 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 924 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 924 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 924 aa  183  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 907 aa  183  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  24.55 
 
 		 914 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 904 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 897 aa  181  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  24.9 
 
 		 936 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>