More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6565 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  39.44 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.65 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.89 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.23 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.53 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.67 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.86 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  34.51 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  34.51 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.69 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  33.82 
 
 		 321 aa  70.9  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.94 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.78 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.57 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.43 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.14 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.87 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.87 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  31.65 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  36.5 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.11 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.69 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.62 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.93 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.39 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.79 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  35.21 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.14 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  36.23 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.91 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  31.25 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.93 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  33.8 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  33.8 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  34.72 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.09 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  36.91 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.93 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.79 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.25 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.03 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  31.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.48 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.81 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.29 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.09 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.04 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  33.57 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.47 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.04 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  23.84 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  34.07 
 
 		 284 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.08 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  29.2 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.65 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  32.85 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.07 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  33.1 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  33.33 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.54 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  31.54 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>