More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5613 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  75.47 
 
 		 433 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  86.89 
 
 		 427 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  75.47 
 
 		 433 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  75.71 
 
 		 433 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 427 aa  878    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  55.71 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  56.32 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  55.61 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  55.83 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.08 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  56.32 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  56.81 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  55.5 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  56.63 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  51.54 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  50.36 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  48.08 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  48.32 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  46.59 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  49.29 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  47.12 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  44.87 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  46.75 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  38.82 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  39.66 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  39.66 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  39.76 
 
 		 390 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  37.38 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  39.03 
 
 		 397 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  38.78 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  36.71 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.72 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  35.63 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  37.24 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.23 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.33 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  36.71 
 
 		 397 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.26 
 
 		 392 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.2 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 		 397 aa  236  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  33.08 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  35.25 
 
 		 391 aa  235  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  38.52 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  35.99 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  36.74 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  37.76 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  37.24 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.27 
 
 		 392 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  35.99 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.78 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  35.75 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.98 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  36.23 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  35.02 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  36.95 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  35.27 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.46 
 
 		 396 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  34.77 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  34.77 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  34.53 
 
 		 392 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  34.77 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  36.03 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.42 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  34.96 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.96 
 
 		 404 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.96 
 
 		 404 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  35.14 
 
 		 414 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.06 
 
 		 393 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.1 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.18 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  34.15 
 
 		 384 aa  223  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.15 
 
 		 413 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  34.87 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  33.84 
 
 		 401 aa  222  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  35.04 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.1 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.58 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.74 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  36.83 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  37.08 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  34.08 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  35.84 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  32.23 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  35.04 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.34 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>