More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4763 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 315 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 349 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 361 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 345 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  41.95 
 
 		 363 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 291 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  34.73 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0080  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  26.84 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  26.47 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 309 aa  95.5  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27230  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.86 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1102  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>