More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2274 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  860    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  57.08 
 
 		 442 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  55.47 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  55.1 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  33.01 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.46 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 441 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.95 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  27.56 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.76 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.19 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.91 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.08 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  23.44 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.44 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.03 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 392 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.53 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.24 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.29 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.99 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.28 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>