More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1134 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 329 aa  638    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  36.48 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  31.73 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 199 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  43.36 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.22 
 
 		 356 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.24 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.21 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  44.68 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  37.43 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  37.91 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  38.93 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3544  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 234 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  28.24 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 281 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 289 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  38.31 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.86 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>