More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1387 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1387  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  769    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  81.87 
 
 		 375 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  81.87 
 
 		 375 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1491  exonuclease V subunit alpha  85.6 
 
 		 375 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  78.99 
 
 		 376 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1343  hypothetical protein  99.46 
 
 		 373 aa  766    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1808  exodeoxyribonuclease V  95.71 
 
 		 373 aa  743    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1994  exodeoxyribonuclease V  80.53 
 
 		 375 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0919  hypothetical protein  77.99 
 
 		 369 aa  611  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.551853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3505  putative deoxyribonuclease  60.22 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618009  normal  0.621388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2140  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  59.25 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0255  putative deoxyribonuclease  58.67 
 
 		 367 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  58.89 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0686  exodeoxyribonuclease V  57.94 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0594  exodeoxyribonuclease V  57.41 
 
 		 369 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0648  conserved hypothetical protein; putative deoxyribonuclease  57.33 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1859  hypothetical protein  57.67 
 
 		 369 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  57.07 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  57.07 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  57.49 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1466  exodeoxyribonuclease V  57.29 
 
 		 369 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  57.1 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3837  putative deoxyribonuclease  57.56 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1281  deoxyribonuclease  57.03 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  53.49 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  54.57 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  54.03 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  53.76 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2622  putative deoxyribonuclease  52.82 
 
 		 373 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4089  putative deoxyribonuclease  51.61 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  30.27 
 
 		 678 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3509  exonuclease V subunit alpha  25.2 
 
 		 924 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1226  exonuclease V subunit alpha  25.2 
 
 		 924 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_002950  PG1303  helicase, putative  26.39 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  28.43 
 
 		 653 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3101  ATPase  27.14 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  30.2 
 
 		 720 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  26.13 
 
 		 476 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0232  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  25.34 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14834  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  29.41 
 
 		 726 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2619  AAA ATPase  27.31 
 
 		 566 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  24.79 
 
 		 469 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3010  AAA ATPase  27.77 
 
 		 563 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0959  ATPase  27.38 
 
 		 566 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.975549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1461  exonuclease V subunit alpha  26.38 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00677876  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2850  putative ATPase  28.28 
 
 		 511 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.935903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1469  exonuclease V subunit alpha  23.87 
 
 		 480 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0847  ATPase  28.73 
 
 		 515 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  24.52 
 
 		 473 aa  89.4  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3625  AAA ATPase  29.42 
 
 		 511 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  25.06 
 
 		 745 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1619  hypothetical protein  32.52 
 
 		 761 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  25.31 
 
 		 742 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  25.65 
 
 		 738 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  24.42 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  25.47 
 
 		 731 aa  84.7  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  27.76 
 
 		 740 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  28.84 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  28.33 
 
 		 659 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  27.32 
 
 		 792 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  24.94 
 
 		 710 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.55 
 
 		 825 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  26.32 
 
 		 742 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.6 
 
 		 742 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  28.23 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  25.07 
 
 		 726 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  26.11 
 
 		 711 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  27.18 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  24.51 
 
 		 743 aa  79.7  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.45 
 
 		 526 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  25.78 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  25.71 
 
 		 736 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  26.08 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  27.58 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  28.89 
 
 		 907 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.87 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  25.96 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.41 
 
 		 747 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  26.14 
 
 		 746 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  27.55 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.59 
 
 		 762 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  26.3 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  25.96 
 
 		 740 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  23.84 
 
 		 778 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  24.65 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  26.08 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  27.39 
 
 		 736 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 		 768 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  24.34 
 
 		 731 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  24.65 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  24.38 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  27.97 
 
 		 1123 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  25.35 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  24.64 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  25.75 
 
 		 754 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.36 
 
 		 740 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  23.83 
 
 		 688 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  23.5 
 
 		 778 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.94 
 
 		 698 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  23.5 
 
 		 778 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>