More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0295 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 360 aa  715    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  47.73 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  32.57 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  34.43 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.56 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  36.47 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.13 
 
 		 377 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  35.48 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  37.35 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  34.19 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  33.67 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 634 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.62 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  36.66 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.23 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  36.18 
 
 		 375 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  34.11 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  35.97 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  36.79 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.35 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  27.04 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  33.22 
 
 		 575 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  33.78 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.31 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  35.76 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.17 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  34.08 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  35.06 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.22 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.51 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  31.86 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.29 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  34.77 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  30.39 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  30.23 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  30.23 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.21 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  29.22 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  32.08 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  30.23 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  35.34 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  29.9 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.1 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  29.28 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  30.74 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  30.8 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  32.03 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.85 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.21 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  32.66 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  32.84 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  31.58 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.24 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  33.56 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.79 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  30.56 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.74 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  32.97 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  30.43 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>