More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3212 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  55.73 
 
 
694 aa  776    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  54.18 
 
 
701 aa  782    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  52.69 
 
 
691 aa  715    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  54.26 
 
 
696 aa  731    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  100 
 
 
689 aa  1428    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  53.05 
 
 
695 aa  703    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  58.85 
 
 
680 aa  852    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  51.92 
 
 
700 aa  697    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  43.52 
 
 
698 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 
703 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 
698 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 
698 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
699 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  43.06 
 
 
700 aa  598  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 
707 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  44.3 
 
 
700 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  40.2 
 
 
701 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 
707 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  43.39 
 
 
705 aa  514  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  38.94 
 
 
707 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 
706 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 
689 aa  505  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
713 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 
730 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  40.12 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 
685 aa  492  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 
680 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  38.63 
 
 
691 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
680 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 
729 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 
729 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
730 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
676 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
679 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 
687 aa  462  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 
677 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
726 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
678 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  37.03 
 
 
677 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
677 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
677 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
677 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
684 aa  439  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
705 aa  362  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 
653 aa  360  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
657 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
657 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  31.74 
 
 
705 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 
701 aa  349  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
705 aa  349  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.24 
 
 
705 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 
705 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
688 aa  340  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 
705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
688 aa  336  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
682 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  31.04 
 
 
706 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  31.83 
 
 
684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 
690 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
705 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
664 aa  321  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 
698 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
715 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 
652 aa  250  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 
571 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
413 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 
413 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  38.43 
 
 
259 aa  157  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.14 
 
 
260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
258 aa  133  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.46 
 
 
260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
254 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.08 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.38 
 
 
260 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.75 
 
 
260 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
261 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0676  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
262 aa  125  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.584191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
257 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
263 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02555  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
259 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
267 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1007  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.94 
 
 
259 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250387  hitchhiker  0.000000447457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02520  hypothetical protein  32.94 
 
 
259 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3172  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.94 
 
 
259 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2841  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.94 
 
 
259 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2828  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3144  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2986  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.0453568 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3037  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2955  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3021  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000377349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3572  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  31.37 
 
 
259 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.50859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
259 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0916994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.08 
 
 
260 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.08 
 
 
260 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2989  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.55 
 
 
259 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>