More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2557 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  75.1 
 
 
498 aa  749    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  100 
 
 
498 aa  998    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.67 
 
 
421 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.3 
 
 
469 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.85 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 
473 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 
509 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 
509 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25.96 
 
 
473 aa  150  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.83 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  24.68 
 
 
467 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  26.06 
 
 
439 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 
576 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 
576 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 
550 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  25.67 
 
 
504 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  23.41 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.88 
 
 
446 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.8 
 
 
457 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.03 
 
 
480 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.1 
 
 
453 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.33 
 
 
471 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  27.17 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.33 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.51 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.47 
 
 
453 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  25.85 
 
 
463 aa  133  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.03 
 
 
468 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.82 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.64 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.64 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  24.14 
 
 
508 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  25.72 
 
 
491 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.95 
 
 
448 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 
549 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 
549 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.25 
 
 
441 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.23 
 
 
456 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.79 
 
 
472 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.23 
 
 
456 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.23 
 
 
433 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.12 
 
 
442 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  23.57 
 
 
481 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.26 
 
 
442 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  24.47 
 
 
442 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.32 
 
 
674 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  25.37 
 
 
486 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.65 
 
 
460 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  25.44 
 
 
461 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.73 
 
 
474 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.27 
 
 
488 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.16 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.16 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  26.77 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.39 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  24.37 
 
 
523 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 
589 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  25.34 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.84 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  25.34 
 
 
469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.26 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.84 
 
 
468 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  25.6 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.68 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.29 
 
 
443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.04 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.87 
 
 
452 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  23.74 
 
 
378 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.33 
 
 
451 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.01 
 
 
458 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.12 
 
 
447 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.68 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.68 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.69 
 
 
460 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.39 
 
 
460 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  29.69 
 
 
227 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.23 
 
 
468 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  24.43 
 
 
472 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  24.38 
 
 
515 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.1 
 
 
460 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.76 
 
 
458 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  26.82 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.4 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.76 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.06 
 
 
460 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.06 
 
 
460 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.06 
 
 
460 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.06 
 
 
460 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  23.87 
 
 
463 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.87 
 
 
511 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  22.45 
 
 
522 aa  114  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.8 
 
 
460 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.49 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.09 
 
 
472 aa  113  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  23.47 
 
 
460 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.26 
 
 
477 aa  113  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.39 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.42 
 
 
514 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.89 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.96 
 
 
458 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>