More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1968 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 458 aa  924    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.09 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  27.63 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.1 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 414 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 359 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 399 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 399 aa  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 327 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 358 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 474 aa  86.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.82 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.25 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.87 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.24 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  21.52 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30.64 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  26.95 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.99 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  30.52 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  20.82 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  27.96 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.42 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  25.21 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  21.6 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.11 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.11 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  20.87 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  26.6 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  23.98 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  22.26 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  22.99 
 
 		 769 aa  70.5  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  20.71 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  31.03 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>