More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3812 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  54.55 
 
 		 733 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  85.41 
 
 		 737 aa  1168    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 753 aa  1471    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  50.86 
 
 		 702 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  51.76 
 
 		 699 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  54.01 
 
 		 682 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  51.87 
 
 		 764 aa  585  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  50.99 
 
 		 697 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  49.66 
 
 		 780 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.75 
 
 		 775 aa  541  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  47.97 
 
 		 777 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  47.89 
 
 		 700 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  46.45 
 
 		 713 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.49 
 
 		 702 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  48.6 
 
 		 750 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  48.6 
 
 		 714 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  43.63 
 
 		 699 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  48.91 
 
 		 762 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  46.69 
 
 		 727 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  42.3 
 
 		 706 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  47.89 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.3 
 
 		 745 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  44.49 
 
 		 778 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  42.98 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.52 
 
 		 709 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  37.24 
 
 		 730 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  38.7 
 
 		 712 aa  412  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  38.14 
 
 		 699 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.31 
 
 		 812 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  41.53 
 
 		 713 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40.66 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  40.93 
 
 		 704 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.57 
 
 		 674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.41 
 
 		 674 aa  337  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.41 
 
 		 674 aa  337  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  55.85 
 
 		 339 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  38.08 
 
 		 707 aa  318  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.6 
 
 		 673 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  38.38 
 
 		 678 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.83 
 
 		 713 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  50 
 
 		 358 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.57 
 
 		 679 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  38.96 
 
 		 686 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  38.23 
 
 		 711 aa  293  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.46 
 
 		 708 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.86 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  33.33 
 
 		 743 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  33.33 
 
 		 743 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  32.13 
 
 		 743 aa  253  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  33.02 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  33.02 
 
 		 743 aa  251  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.55 
 
 		 743 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  33.02 
 
 		 743 aa  247  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.55 
 
 		 743 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  33.02 
 
 		 743 aa  237  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.98 
 
 		 723 aa  198  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.36 
 
 		 740 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  28.73 
 
 		 747 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  30.43 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.3 
 
 		 882 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.19 
 
 		 717 aa  178  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.03 
 
 		 726 aa  172  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.6 
 
 		 719 aa  161  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  41.08 
 
 		 974 aa  154  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.84 
 
 		 758 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  48.54 
 
 		 1077 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  41.13 
 
 		 1001 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.86 
 
 		 1146 aa  150  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  40.85 
 
 		 998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  40.85 
 
 		 998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  40.85 
 
 		 998 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  41.04 
 
 		 1000 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.77 
 
 		 981 aa  146  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.16 
 
 		 997 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.45 
 
 		 737 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  38.89 
 
 		 974 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.26 
 
 		 724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  50.67 
 
 		 1062 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  50.67 
 
 		 1062 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.79 
 
 		 743 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.09 
 
 		 920 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  28.55 
 
 		 726 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.68 
 
 		 718 aa  138  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  31.29 
 
 		 1040 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  33.12 
 
 		 1054 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  26.73 
 
 		 796 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  28.65 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.75 
 
 		 740 aa  134  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.12 
 
 		 710 aa  134  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  26.55 
 
 		 732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  37.71 
 
 		 1002 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  24.84 
 
 		 740 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  27.1 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  35.44 
 
 		 1109 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  25 
 
 		 704 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  34.33 
 
 		 1109 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  27.53 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  46.67 
 
 		 1003 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  31.46 
 
 		 738 aa  128  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  40 
 
 		 1011 aa  128  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>