112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5418 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  100 
 
 		 1060 aa  2123    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  46.14 
 
 		 1092 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  43.64 
 
 		 996 aa  479  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.11 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  39.28 
 
 		 973 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.44 
 
 		 1049 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  35.51 
 
 		 950 aa  379  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 1119 aa  373  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 1182 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 1077 aa  363  9e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  37.5 
 
 		 1560 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  34.83 
 
 		 1023 aa  359  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  32.03 
 
 		 974 aa  355  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 1268 aa  354  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 1282 aa  350  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.9 
 
 		 957 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.76 
 
 		 1051 aa  343  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  37 
 
 		 1004 aa  342  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  38.45 
 
 		 950 aa  336  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  36.83 
 
 		 1281 aa  334  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 1132 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1007 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  36.4 
 
 		 1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  35.99 
 
 		 1164 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  35.36 
 
 		 1148 aa  304  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  36.15 
 
 		 1022 aa  298  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 860 aa  294  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  29.58 
 
 		 1047 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  34.36 
 
 		 876 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 803 aa  254  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  31.11 
 
 		 807 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  30.6 
 
 		 905 aa  241  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  42.86 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  31.53 
 
 		 1026 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  31.37 
 
 		 797 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.63 
 
 		 839 aa  234  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  42.43 
 
 		 854 aa  232  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  42.22 
 
 		 637 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  39.21 
 
 		 763 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  40.75 
 
 		 817 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  30.8 
 
 		 769 aa  227  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  30.39 
 
 		 683 aa  227  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  30.84 
 
 		 854 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  42.67 
 
 		 801 aa  224  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  31.31 
 
 		 697 aa  224  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  30.26 
 
 		 1310 aa  224  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  41.03 
 
 		 991 aa  223  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  31.18 
 
 		 841 aa  222  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  31.5 
 
 		 817 aa  221  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  39.46 
 
 		 1402 aa  221  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  29.68 
 
 		 821 aa  221  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  30.52 
 
 		 1000 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  41.67 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  40.87 
 
 		 818 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 1435 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  40.53 
 
 		 669 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  27.22 
 
 		 832 aa  215  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.22 
 
 		 1152 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  30.73 
 
 		 965 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  29.4 
 
 		 795 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.43 
 
 		 735 aa  207  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  41.22 
 
 		 843 aa  205  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  43.48 
 
 		 769 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  30.76 
 
 		 863 aa  203  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  37.66 
 
 		 895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  30.96 
 
 		 794 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  27.44 
 
 		 814 aa  194  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.68 
 
 		 733 aa  187  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  28.14 
 
 		 839 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  36.28 
 
 		 764 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.07 
 
 		 670 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  38.56 
 
 		 687 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  28.83 
 
 		 805 aa  174  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  27.87 
 
 		 798 aa  170  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  27.55 
 
 		 1076 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  35.78 
 
 		 799 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  38.18 
 
 		 832 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  39.92 
 
 		 769 aa  146  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  40.54 
 
 		 484 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  35.45 
 
 		 575 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  35 
 
 		 436 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  34.29 
 
 		 516 aa  121  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 412 aa  105  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  35.05 
 
 		 465 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  30.68 
 
 		 630 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 453 aa  94.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  28.89 
 
 		 524 aa  92.8  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  26.61 
 
 		 600 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  31.74 
 
 		 539 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  34.87 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.11 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  21.77 
 
 		 438 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  23.53 
 
 		 436 aa  53.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  21.43 
 
 		 438 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22 
 
 		 720 aa  51.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  21.43 
 
 		 438 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  21.43 
 
 		 438 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  31.82 
 
 		 465 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  21.43 
 
 		 438 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  21.09 
 
 		 429 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>