More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5225 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  67.04 
 
 		 181 aa  251  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  65.36 
 
 		 181 aa  244  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  66.11 
 
 		 188 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  63.28 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  64.2 
 
 		 186 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  63.69 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  61.14 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  60.34 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  62.57 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  58.33 
 
 		 183 aa  215  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  60.89 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  60.74 
 
 		 180 aa  204  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  59.49 
 
 		 161 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  53.37 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  54.6 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  56.44 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  54.32 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  63.28 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  49.69 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.7 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  49.06 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  48.75 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  53.42 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  47.17 
 
 		 162 aa  154  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  49.69 
 
 		 162 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  47.83 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.67 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  51.55 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  44.03 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  45.28 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  45.16 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  45.51 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.16 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  46.45 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.02 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  44.19 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  44.77 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.1 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  45.78 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  43.89 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.34 
 
 		 230 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  46.91 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  43.64 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  43.29 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  43.67 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  43.6 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.44 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  40.23 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  44.97 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  46.67 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  39.11 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  41.25 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  42.26 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  39.86 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.75 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  37.99 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  40.71 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.58 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  43.33 
 
 		 187 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  37.7 
 
 		 197 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  37.7 
 
 		 197 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  37.7 
 
 		 197 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  41.42 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.13 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  38.55 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  38.41 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  38.41 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  42.75 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  34.3 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  39.31 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  36.96 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  38.42 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  40.69 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.52 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  38.86 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  39.38 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  41.56 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.01 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.01 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.2 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.2 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  40.28 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  43.03 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.52 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  37.91 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  40.25 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  41.88 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40.85 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  40.61 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.19 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  43.75 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.04 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.74 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  39.76 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>