84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2422 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.48 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 183 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 191 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 180 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  25.17 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  35.16 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  43.06 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  44.78 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  48.44 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 197 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 193 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 217 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 210 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  25.81 
 
 		 184 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>