More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0552 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 653 aa  1323    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 687 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 643 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 679 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 714 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  29.47 
 
 		 670 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  28.75 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 684 aa  218  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 678 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 737 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  39.17 
 
 		 705 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  37.79 
 
 		 715 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  37 
 
 		 715 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  41.34 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  41.57 
 
 		 704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  40.74 
 
 		 707 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 710 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 687 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 642 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  25.15 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 676 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  24.73 
 
 		 680 aa  104  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  33.71 
 
 		 678 aa  98.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  34.5 
 
 		 662 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 662 aa  97.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 715 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  31.77 
 
 		 641 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 613 aa  88.2  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.35 
 
 		 641 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.15 
 
 		 667 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.06 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.06 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.06 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.95 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.06 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.15 
 
 		 618 aa  82.4  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.28 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.04 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  31.46 
 
 		 718 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 659 aa  80.5  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 1128 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  23.05 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 670 aa  77  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 675 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.88 
 
 		 614 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 		 668 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.58 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.58 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.58 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.58 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.58 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.58 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.58 
 
 		 656 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 671 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 627 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 602 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.06 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.06 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  30.88 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  31.06 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  31.06 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.06 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.82 
 
 		 713 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 626 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 688 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.22 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.68 
 
 		 1023 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  27.73 
 
 		 631 aa  68.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 731 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  28.82 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.26 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 698 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  38.58 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  30.53 
 
 		 731 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 686 aa  67  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.5 
 
 		 638 aa  67  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 671 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 616 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  30.43 
 
 		 665 aa  66.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>