More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0024 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 343 aa  681    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  40.72 
 
 		 306 aa  242  9e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  43.14 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  43.55 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  39.75 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  38.91 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  38 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  42.14 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  42.52 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  43.61 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  40.31 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  38.78 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  38.66 
 
 		 304 aa  205  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.06 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  42.18 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.06 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  39.76 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  45.81 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.1 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  37.33 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.95 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  41.97 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 348 aa  198  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  42.95 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  41.97 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.46 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  41.97 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  44.44 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  43.69 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.57 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  37.58 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  38.14 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  38.87 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  42.49 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  42.53 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  37.78 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  38.11 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  39.49 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  37.18 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  41.23 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  38.75 
 
 		 322 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  37.18 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  35.95 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  39.73 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  40.51 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.39 
 
 		 309 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  42.16 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.62 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  36.79 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  39.31 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  37.76 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  38.02 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  40.98 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  40.39 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  40.13 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.37 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  33.55 
 
 		 307 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.3 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  39.61 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  37.94 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  39.19 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  33.85 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  39.16 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.13 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  39.22 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  42.11 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  38.94 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  38.89 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.62 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  38.64 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  38.56 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  38.54 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  36.63 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  37.62 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  37.99 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  36.91 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.3 
 
 		 308 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  37.54 
 
 		 328 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>