141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3051 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3051  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
499 aa  977    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4870  hypothetical protein  33.13 
 
 
955 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2992  hypothetical protein  35.9 
 
 
403 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0985  hypothetical protein  32.51 
 
 
403 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3426  hypothetical protein  37.14 
 
 
428 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00293967  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5532  hypothetical protein  36.09 
 
 
396 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.232647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4943  hypothetical protein  29.97 
 
 
411 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4282  hypothetical protein  31.27 
 
 
415 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1945  hypothetical protein  31.82 
 
 
407 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00538103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4176  hypothetical protein  30.99 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.616398  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3543  hypothetical protein  31.82 
 
 
329 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655246  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2412  hypothetical protein  34.44 
 
 
333 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
878 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.27 
 
 
810 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
608 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.41 
 
 
2401 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
1085 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.85 
 
 
745 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 
1005 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
234 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.53 
 
 
1034 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 
1154 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 
4079 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.88 
 
 
587 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
265 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.54 
 
 
795 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0346  hypothetical protein  24.35 
 
 
347 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
3035 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
1406 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
583 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
632 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 
602 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  35.42 
 
 
314 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
968 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
523 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
467 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.34 
 
 
545 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 
2240 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
1094 aa  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
213 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
1486 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.27 
 
 
577 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
955 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
927 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 
1067 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 
718 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
415 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.26 
 
 
887 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.18 
 
 
936 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
543 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.27 
 
 
577 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
739 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
909 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.79 
 
 
732 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1049 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  39.17 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
1737 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.7 
 
 
816 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.8 
 
 
267 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
363 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  40.5 
 
 
626 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.79 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
602 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 
581 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.62 
 
 
585 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 
162 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 
542 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  36.26 
 
 
584 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
761 aa  47.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
503 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
637 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.22 
 
 
397 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
708 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
750 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  36.45 
 
 
695 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
421 aa  47.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  22.63 
 
 
1014 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  37.89 
 
 
623 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.06 
 
 
1007 aa  47  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  28.81 
 
 
631 aa  47  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
221 aa  47  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  40.58 
 
 
576 aa  47  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  38.02 
 
 
626 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  34.06 
 
 
715 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
3560 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  38.02 
 
 
614 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
467 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.68 
 
 
603 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  38.02 
 
 
614 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
1069 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 
614 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  32.56 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
589 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
681 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.83 
 
 
560 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>