More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3830 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  100 
 
 		 658 aa  1365    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  39.62 
 
 		 677 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  38.86 
 
 		 657 aa  399  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  35.11 
 
 		 650 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  35.27 
 
 		 695 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  40.23 
 
 		 533 aa  329  9e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  32.46 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  35.14 
 
 		 635 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  29.54 
 
 		 662 aa  250  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  31.17 
 
 		 661 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  29.78 
 
 		 633 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  34.96 
 
 		 674 aa  240  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  33.33 
 
 		 778 aa  226  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.87 
 
 		 717 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.44 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.81 
 
 		 637 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  25.98 
 
 		 638 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  35.94 
 
 		 422 aa  164  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  32.56 
 
 		 601 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30 
 
 		 498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  30.2 
 
 		 588 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.4 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.98 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  30.41 
 
 		 616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.51 
 
 		 614 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  27.75 
 
 		 513 aa  127  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  27.75 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.96 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.46 
 
 		 452 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.46 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.29 
 
 		 600 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.72 
 
 		 526 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.9 
 
 		 834 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.7 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  24.86 
 
 		 384 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.22 
 
 		 455 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.19 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.67 
 
 		 681 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.21 
 
 		 574 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.19 
 
 		 485 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.27 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  30.08 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.27 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.19 
 
 		 477 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.32 
 
 		 793 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.49 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.61 
 
 		 520 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.46 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.79 
 
 		 517 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.59 
 
 		 513 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  27.57 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  36.46 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  32.52 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.02 
 
 		 485 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.59 
 
 		 505 aa  104  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.05 
 
 		 507 aa  104  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.15 
 
 		 498 aa  104  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.15 
 
 		 498 aa  104  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  36.46 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  36.46 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.79 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  36.46 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.94 
 
 		 485 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  31.85 
 
 		 409 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.33 
 
 		 422 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.31 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  29.02 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.26 
 
 		 480 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.25 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  35.23 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.73 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  27.3 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  36.46 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  26.78 
 
 		 691 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  26.78 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.37 
 
 		 543 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  26.78 
 
 		 691 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.37 
 
 		 543 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  30.94 
 
 		 383 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.4 
 
 		 386 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.42 
 
 		 353 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  26.78 
 
 		 691 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  28.18 
 
 		 459 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.76 
 
 		 485 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.06 
 
 		 966 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  26.44 
 
 		 691 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.03 
 
 		 580 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.16 
 
 		 1055 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  34.2 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.24 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 415 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  25.95 
 
 		 694 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  27.71 
 
 		 590 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  32 
 
 		 364 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  35.84 
 
 		 362 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.36 
 
 		 364 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  25.38 
 
 		 494 aa  98.6  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.12 
 
 		 524 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>