More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3308 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3308  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 324 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1078  dihydrodipicolinate synthetase  81.38 
 
 		 325 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3424  dihydrodipicolinate synthetase  38.99 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3957  dihydrodipicolinate synthetase  39.58 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3658  dihydrodipicolinate synthetase  39.22 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3101  dihydrodipicolinate synthetase  37.55 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3456  putative dihydrodipicolinate synthase  37.55 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2042  dihydrodipicolinate synthetase  36.65 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1636  dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3779  dihydrodipicolinate synthetase  35.77 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3112  dihydrodipicolinate synthetase  32.09 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114447  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2468  dihydrodipicolinate synthetase  34.72 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0451761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3139  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1485  dihydrodipicolinate synthetase  37.37 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.177737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7578  dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2353  dihydrodipicolinate synthetase  31.92 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317457  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5002  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.13 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3300  dihydrodipicolinate synthetase  33.89 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3603  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1528  dihydrodipicolinate synthetase  31.79 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3385  dihydrodipicolinate synthetase  30.94 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3940  dihydrodipicolinate synthetase  34.42 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2707  dihydrodipicolinate synthetase  30.23 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.99 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5478  dihydrodipicolinate synthetase  30.11 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0261225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4923  dihydrodipicolinate synthetase  30.11 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3006  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0042  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  29.75 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3204  dihydrodipicolinate synthetase  29.09 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678825  normal  0.148766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6033  dihydrodipicolinate synthetase  29.71 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1052  dihydrodipicolinate synthetase  29.72 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4575  dihydrodipicolinate synthetase  28.36 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6711  dihydrodipicolinate synthetase  29.09 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1021  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.5 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.966084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2596  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2247  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  29.68 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11858  hitchhiker  0.00000394789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1026  dihydrodipicolinate synthetase  28.71 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0707  dihydrodipicolinate synthetase  27.01 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.231 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3593  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1630  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.96 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0633747  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6404  dihydrodipicolinate synthetase  28.26 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6235  dihydrodipicolinate synthetase  28.26 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6637  dihydrodipicolinate synthetase  28.26 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.207106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  36.2 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0453  dihydrodipicolinate synthetase  28.29 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3398  dihydrodipicolinate synthetase  27.9 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  34.36 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4983  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  35.06 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3971  dihydrodipicolinate synthetase  24.91 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3080  dihydrodipicolinate synthetase  30.91 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.151038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2837  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  28.72 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.39 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  26.09 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5216  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5643  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000370921  normal  0.101795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  24.84 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  27.05 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2738  dihydrodipicolinate synthetase  29.97 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200643  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  23.62 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  23.62 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  23.62 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  23.62 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4586  dihydrodipicolinate synthetase  29.03 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  23.14 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  24.54 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  25.64 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4925  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  25.7 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  32.67 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  23.53 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2446  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  27.96 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  23.53 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  23.53 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  31.61 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  23.53 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  25.98 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  25 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  23.53 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  23.53 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  26.22 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.3 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  24.89 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5823  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>