More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0494 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  54.88 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  50.68 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  55.03 
 
 		 304 aa  325  8.000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  54.14 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 304 aa  322  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  54.83 
 
 		 301 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  50.66 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  51.32 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  51.32 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  51.32 
 
 		 306 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  51.32 
 
 		 306 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  51.16 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  52.68 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  52.86 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  50.17 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  52.68 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  52.68 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  52.68 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  52.68 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  52.68 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  53.69 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  52.35 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  51.88 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  47.64 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  48.99 
 
 		 305 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  48.66 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  47.06 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  50.68 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  53.98 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  48.34 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  45.3 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  46.02 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  44.3 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  47.77 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  45.17 
 
 		 304 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  45.67 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  44.84 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  41.36 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  39.25 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  37.98 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  36.21 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  39.36 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  34.8 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  32.47 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  34.94 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.8 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.17 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  34.07 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.94 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  34.01 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  30.96 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  32.52 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  32.07 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  32.55 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  32.55 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  32.4 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>