More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0609 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  96.36 
 
 		 302 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  80.92 
 
 		 304 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  57.34 
 
 		 302 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  55.59 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  55.59 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  56.61 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  54.8 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  46.72 
 
 		 288 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  47.21 
 
 		 288 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.45 
 
 		 297 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  43.57 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  43.57 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  43.57 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  38.32 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  37.36 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  38.44 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  38.05 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.94 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  38.27 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2135  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  34.42 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  34.4 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  37.31 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  34.55 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.94 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.93 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.97 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  30.29 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.4 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  32.49 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  33.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  34.77 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>