More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3470 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
293 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  60.76 
 
 
292 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 
290 aa  328  8e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  51.76 
 
 
293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
292 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
297 aa  295  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  43.82 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 
289 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
298 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  43.66 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.16 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  43.22 
 
 
296 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
296 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.29 
 
 
298 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  42.24 
 
 
297 aa  227  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 
292 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 
297 aa  224  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  44.12 
 
 
296 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  40.99 
 
 
300 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  40.99 
 
 
300 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  41.97 
 
 
291 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  40.64 
 
 
300 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 
295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  41.72 
 
 
292 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
301 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  40.94 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 
296 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 
292 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.8 
 
 
292 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 
296 aa  215  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
292 aa  215  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 
293 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  43.07 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  41.09 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  41.07 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.82 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  39.45 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
292 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
292 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  39.45 
 
 
295 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
294 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 
308 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
294 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 
292 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 
319 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 
292 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  37 
 
 
292 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.01 
 
 
292 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
292 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  40.94 
 
 
292 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
320 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.51 
 
 
290 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 
291 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
297 aa  204  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 
289 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 
294 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  38.3 
 
 
308 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 
293 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  38.73 
 
 
304 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 
292 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  39.27 
 
 
296 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 
292 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  36.71 
 
 
296 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  38.3 
 
 
287 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 
292 aa  202  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  39.27 
 
 
292 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.75 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  38.71 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>