More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1170 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  80.69 
 
 
291 aa  487  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  454  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  74.14 
 
 
292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  74.14 
 
 
292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  74.48 
 
 
292 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  72.76 
 
 
292 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  59.03 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  58.19 
 
 
294 aa  342  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  57.71 
 
 
292 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  57.69 
 
 
297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  57.24 
 
 
296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  55.02 
 
 
296 aa  331  9e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  78.33 
 
 
206 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  53.55 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
298 aa  318  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
296 aa  318  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  53.52 
 
 
294 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  51.58 
 
 
291 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
296 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
296 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 
297 aa  311  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  53.48 
 
 
294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
295 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  49.81 
 
 
287 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
302 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
300 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
300 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
300 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  48.03 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  48.59 
 
 
305 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.68 
 
 
294 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  47.27 
 
 
311 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50.36 
 
 
290 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  45.72 
 
 
293 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  48.31 
 
 
292 aa  269  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  46.38 
 
 
297 aa  268  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 
292 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  47.79 
 
 
297 aa  268  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 
293 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 
292 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  48.24 
 
 
308 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  46.4 
 
 
296 aa  267  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
290 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 
294 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  47.58 
 
 
292 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  47.72 
 
 
290 aa  265  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  47.39 
 
 
292 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  44.4 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 
292 aa  265  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
300 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  47.39 
 
 
292 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
296 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
307 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 
292 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 
308 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
308 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  47.39 
 
 
292 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
302 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.21 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 
293 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  45.29 
 
 
341 aa  261  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 
292 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
300 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.09 
 
 
294 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  43.26 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 
301 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
290 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  48.16 
 
 
290 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 
301 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 
289 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 
291 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  47.27 
 
 
294 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  46.86 
 
 
295 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  46.01 
 
 
292 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
292 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.86 
 
 
295 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 
301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>