More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2524 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  66.67 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  67.72 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  66.32 
 
 
292 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  64.95 
 
 
292 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  64.95 
 
 
292 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  65.98 
 
 
292 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  64.95 
 
 
292 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  65.96 
 
 
287 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  65.03 
 
 
290 aa  381  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  63.57 
 
 
291 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  64.26 
 
 
292 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  64.6 
 
 
291 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  64.48 
 
 
292 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 
292 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  62.59 
 
 
295 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  62.59 
 
 
295 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  62.59 
 
 
295 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  59.58 
 
 
297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  59.58 
 
 
289 aa  362  6e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  58.64 
 
 
300 aa  359  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  59.45 
 
 
293 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  61.57 
 
 
286 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  58.89 
 
 
294 aa  344  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  60.82 
 
 
291 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  60.82 
 
 
291 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 
290 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 
290 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 
294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  55.02 
 
 
294 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  57.64 
 
 
296 aa  332  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  56.36 
 
 
294 aa  332  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
294 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 
294 aa  331  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
294 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  54.98 
 
 
294 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
294 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
294 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
294 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  56.06 
 
 
319 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  60.28 
 
 
300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
294 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 
294 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  55.9 
 
 
293 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
294 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  56.25 
 
 
293 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  53.92 
 
 
293 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  54.79 
 
 
292 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  55.21 
 
 
294 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  55.56 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
294 aa  319  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  55.4 
 
 
292 aa  318  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 
292 aa  318  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
301 aa  318  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  54.11 
 
 
292 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
301 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
300 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
300 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  54.3 
 
 
290 aa  317  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
300 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  54.42 
 
 
307 aa  317  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
292 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
301 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 
301 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  53.95 
 
 
290 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 
292 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 
298 aa  315  5e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
293 aa  315  8e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 
292 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 
292 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 
299 aa  311  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 
299 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>