More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2198 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  66.1 
 
 
290 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  60.54 
 
 
294 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 
292 aa  362  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 
292 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  58.64 
 
 
292 aa  359  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  58.64 
 
 
292 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  60.69 
 
 
287 aa  352  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  61.22 
 
 
292 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  59.32 
 
 
292 aa  351  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 
291 aa  348  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 
292 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 
292 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  58.05 
 
 
295 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  57.63 
 
 
292 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  58.05 
 
 
295 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  57.38 
 
 
295 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 
293 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  329  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  55.59 
 
 
293 aa  329  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 
291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 
291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  54.73 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  53.72 
 
 
292 aa  326  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  55.44 
 
 
290 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  55.44 
 
 
290 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  53.72 
 
 
292 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 
290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 
286 aa  325  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  55.89 
 
 
293 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  52.54 
 
 
290 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  53.56 
 
 
292 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  56.27 
 
 
294 aa  322  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 
289 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
292 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 
297 aa  322  6e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  54.33 
 
 
296 aa  321  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  53.22 
 
 
290 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  55.41 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  53.22 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  55.22 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  52.88 
 
 
290 aa  318  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  53.74 
 
 
302 aa  318  5e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
301 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 
293 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  53.22 
 
 
294 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 
299 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 
299 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
301 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
300 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
300 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
300 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
301 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  51.67 
 
 
294 aa  314  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  52.67 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 
294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  52.03 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  52.54 
 
 
296 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
294 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  53.22 
 
 
298 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  52.67 
 
 
297 aa  309  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 
297 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  54.58 
 
 
301 aa  309  5e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  51.01 
 
 
300 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 
290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  55.44 
 
 
292 aa  308  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  51.54 
 
 
294 aa  308  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  52.88 
 
 
292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 
294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 
290 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  51 
 
 
294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  51.01 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>