More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1145 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  92.52 
 
 		 294 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  92.86 
 
 		 294 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  78.5 
 
 		 294 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  78.16 
 
 		 319 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  75.68 
 
 		 301 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  76.03 
 
 		 301 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  75 
 
 		 301 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  74.91 
 
 		 300 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  75.34 
 
 		 301 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  74.91 
 
 		 300 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  74.57 
 
 		 300 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 320 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 		 300 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  74.91 
 
 		 308 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  72.01 
 
 		 293 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  73.1 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  69.73 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  67.35 
 
 		 298 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  70.14 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  66.32 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 		 297 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  66.67 
 
 		 298 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  66.32 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  64.41 
 
 		 296 aa  407  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  63.61 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  65.29 
 
 		 292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  64.6 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  63.27 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  67.47 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  62.84 
 
 		 296 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  61.38 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  61.03 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  60.82 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  60.63 
 
 		 287 aa  359  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  62.63 
 
 		 300 aa  358  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 		 290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 		 290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 		 292 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  58.36 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  58.36 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  58.36 
 
 		 295 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  57.93 
 
 		 291 aa  341  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 		 292 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  56.55 
 
 		 294 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  57.14 
 
 		 294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  55.94 
 
 		 286 aa  333  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  55.02 
 
 		 292 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  53.98 
 
 		 292 aa  325  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  51.67 
 
 		 300 aa  314  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 		 290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 292 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  51.2 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 292 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  52.28 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  52.28 
 
 		 291 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>