More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1908 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  66.44 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 		 293 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  62.76 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  62.07 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  62.76 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  64.51 
 
 		 294 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 		 293 aa  358  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  62.07 
 
 		 296 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  62.07 
 
 		 296 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  62.28 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 291 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  62.54 
 
 		 291 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  55.82 
 
 		 294 aa  351  5.9999999999999994e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 296 aa  351  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  60.62 
 
 		 293 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 		 296 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  59.59 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  61.77 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  60.49 
 
 		 293 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 290 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  65.17 
 
 		 296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  65.17 
 
 		 296 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 291 aa  338  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  60.75 
 
 		 294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  58.28 
 
 		 298 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  58.36 
 
 		 294 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 297 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 296 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  61.03 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  60.48 
 
 		 299 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 297 aa  311  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 293 aa  295  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 294 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 		 296 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 293 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 292 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 		 300 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 292 aa  278  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 291 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  48.3 
 
 		 296 aa  272  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>