More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1362 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  90.44 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  84.98 
 
 		 292 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  83.62 
 
 		 292 aa  507  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  82.94 
 
 		 292 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  83.96 
 
 		 292 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  78.84 
 
 		 292 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  78.84 
 
 		 292 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  78.84 
 
 		 292 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  79.18 
 
 		 292 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  78.16 
 
 		 292 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  61.87 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  62.12 
 
 		 293 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  59.93 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  59.59 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  58.7 
 
 		 293 aa  363  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  55.29 
 
 		 292 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  54.24 
 
 		 292 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  55.29 
 
 		 292 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 		 291 aa  328  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  53.82 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  55.1 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  56.6 
 
 		 286 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 293 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  53.92 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 293 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  53.92 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 		 300 aa  316  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 		 294 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 		 294 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  52.22 
 
 		 292 aa  311  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 		 294 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 294 aa  308  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  52.65 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  52.76 
 
 		 294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  54 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  52.04 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  51.32 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  51.32 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  50.84 
 
 		 297 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  51.01 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  51.53 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 301 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 320 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  51.54 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>