More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1296 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
292 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  84.93 
 
 
292 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  75.68 
 
 
292 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  74.56 
 
 
292 aa  461  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  70.55 
 
 
292 aa  428  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  62.94 
 
 
292 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  58.1 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  57.75 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  58.8 
 
 
290 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 
290 aa  353  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  56.34 
 
 
290 aa  343  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  57.04 
 
 
291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 
290 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 
290 aa  333  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 
293 aa  328  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
297 aa  316  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  48.64 
 
 
294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
291 aa  309  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 
293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 
300 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 
291 aa  299  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
294 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
291 aa  298  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
296 aa  298  7e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
294 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
299 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 
297 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
296 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
294 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  52.04 
 
 
300 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
291 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
295 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
295 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
295 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
294 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
292 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
294 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 
301 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 
301 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
292 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 
289 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
292 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
302 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
292 aa  289  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
297 aa  288  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
301 aa  288  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
294 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
301 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
289 aa  287  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
289 aa  287  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
288 aa  286  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
320 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
293 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
293 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 
294 aa  286  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  51.4 
 
 
295 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
298 aa  285  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
291 aa  285  9e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
293 aa  284  9e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  51.99 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  51.23 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  51.23 
 
 
291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  52.26 
 
 
287 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
298 aa  281  9e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 
291 aa  280  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
319 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 
292 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
300 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 
292 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
292 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
326 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
296 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>