More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0148 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  96.35 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  76.41 
 
 		 302 aa  481  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  58.62 
 
 		 293 aa  348  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 292 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 292 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  55.97 
 
 		 295 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  55.97 
 
 		 295 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  54.14 
 
 		 292 aa  329  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  57.24 
 
 		 292 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  57.24 
 
 		 292 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  56.4 
 
 		 294 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  56.79 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  55.17 
 
 		 292 aa  321  8e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  54.58 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  56.4 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 		 301 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 294 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 319 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 		 291 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  51.74 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  52.76 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  53.12 
 
 		 293 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 		 290 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  52.28 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  51.75 
 
 		 286 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 		 302 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  51.89 
 
 		 308 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  51.52 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 		 296 aa  298  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 293 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  55.4 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  55.4 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 298 aa  291  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 290 aa  291  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 		 294 aa  291  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  52.96 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 292 aa  288  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  51.05 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  51.05 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 292 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 294 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  53.63 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  47.12 
 
 		 300 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  51.09 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 293 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>