More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6633 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 293 aa  295  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  47.55 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  48.59 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  46.83 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  46.91 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  44.36 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  44.49 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  44.84 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  44.89 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  44.53 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  43.17 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  43.26 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  41.22 
 
 		 289 aa  232  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  42.39 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  42.35 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 319 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  41.28 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  42.03 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 290 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  40.64 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.75 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  40.58 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  39.56 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  39.5 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  38.99 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  38.99 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  39.21 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  40.38 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  37.96 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  40.66 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  39.42 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  40.29 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  41.39 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>