More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5112 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  55.1 
 
 		 298 aa  338  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  47.9 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  43.82 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.55 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 		 293 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  39.02 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  42.44 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  40.35 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  41.09 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  37.07 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>