More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0647 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  72.95 
 
 
292 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  74.56 
 
 
292 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  72.6 
 
 
292 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  68.15 
 
 
292 aa  421  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  64.04 
 
 
292 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  56.9 
 
 
290 aa  353  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  56.55 
 
 
290 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  56.55 
 
 
290 aa  348  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 
290 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 
290 aa  344  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 
291 aa  343  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 
290 aa  342  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  54.14 
 
 
290 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  53.26 
 
 
293 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
290 aa  309  4e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  51.92 
 
 
297 aa  308  9e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
293 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 
297 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  48.98 
 
 
294 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  51.75 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  52.67 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
294 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
294 aa  298  5e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 
291 aa  296  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
291 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  52.8 
 
 
295 aa  295  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  54.96 
 
 
292 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  54.96 
 
 
292 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
294 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
300 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
299 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  49.47 
 
 
293 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  53.55 
 
 
292 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 
294 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
295 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 
295 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  51.93 
 
 
292 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
295 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
288 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
294 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
301 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  53.38 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
293 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 
292 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
293 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
319 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  52.48 
 
 
292 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
301 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 
297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
301 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 
307 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  49.45 
 
 
291 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
291 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 
289 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
291 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
290 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  48.72 
 
 
297 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 
326 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
300 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
293 aa  279  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 
298 aa  279  4e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 
298 aa  279  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
289 aa  279  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
291 aa  278  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
296 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
297 aa  278  6e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
298 aa  278  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
300 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  43.84 
 
 
313 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
296 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  51.05 
 
 
297 aa  278  8e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
296 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
308 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
291 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
289 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
297 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
289 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
291 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>