More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2538 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  604  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  55.1 
 
 		 296 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  50.9 
 
 		 297 aa  309  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  46.71 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  43.26 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  41.91 
 
 		 300 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  40.58 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  36.39 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  37.89 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  38.44 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  38.73 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  36.39 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  38.64 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  37.11 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  38.1 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  38.73 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  36.15 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  39.03 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  39.03 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 332 aa  191  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  36.91 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  39.35 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  39.35 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>