More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0097 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
297 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
290 aa  322  5e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 
290 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 
290 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  54.2 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  55.24 
 
 
290 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
292 aa  316  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
293 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  53.15 
 
 
290 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
290 aa  315  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 
290 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 
291 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  51.92 
 
 
292 aa  308  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
291 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  51.23 
 
 
292 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
292 aa  291  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
291 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
292 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  53.43 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
299 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
288 aa  281  9e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
290 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 
289 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
295 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 
291 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 
291 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
295 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
289 aa  278  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
290 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  51.22 
 
 
296 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 
297 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
294 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
289 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 
294 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
294 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
290 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
308 aa  276  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
291 aa  275  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
291 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 
291 aa  275  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
294 aa  273  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  50.72 
 
 
300 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  51.1 
 
 
296 aa  271  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 
295 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  51.09 
 
 
296 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  51.09 
 
 
300 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
293 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
300 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
297 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 
320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  51.09 
 
 
296 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  47.79 
 
 
290 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
292 aa  268  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  51.09 
 
 
296 aa  268  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  48.77 
 
 
297 aa  268  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 
293 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
296 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 
291 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
296 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  49.63 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  49.63 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  49.63 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
304 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
298 aa  265  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 
300 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  49.81 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  48.43 
 
 
326 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  47.55 
 
 
292 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
292 aa  265  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 
297 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
296 aa  265  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  48.51 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
293 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  48.89 
 
 
301 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 
292 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  47.79 
 
 
294 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.15 
 
 
301 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
292 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
293 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
299 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  47.41 
 
 
300 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
299 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  48.15 
 
 
301 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
294 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
300 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
319 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>