More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1458 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  72.13 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  72.07 
 
 		 291 aa  441  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 291 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  58.76 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  55.07 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  60.42 
 
 		 295 aa  328  8e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  55.9 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 		 314 aa  305  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 		 309 aa  301  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  52.4 
 
 		 292 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 292 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 332 aa  295  6e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 		 307 aa  295  8e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 		 290 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  48.43 
 
 		 289 aa  279  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 296 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  48.35 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 295 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  43.84 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 294 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  42.61 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  44.75 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  43.73 
 
 		 295 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  45.32 
 
 		 292 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>