More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  62.16 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 291 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43.88 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 293 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.95 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  43.99 
 
 		 292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  43.43 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  42.23 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  41.5 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  41.78 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  43.25 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  41.87 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  45.22 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>