More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1939 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  70.31 
 
 
297 aa  427  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  68.03 
 
 
295 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  65.99 
 
 
294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  62.45 
 
 
291 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  59.86 
 
 
292 aa  360  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  59.25 
 
 
294 aa  359  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  57.34 
 
 
292 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  57 
 
 
294 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  57.58 
 
 
296 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  57.58 
 
 
296 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 
294 aa  340  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  57.24 
 
 
290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  55.89 
 
 
296 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
299 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 
291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  53.58 
 
 
294 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  56.25 
 
 
298 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 
296 aa  314  9e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  52.3 
 
 
297 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  53.07 
 
 
297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
292 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  48.77 
 
 
295 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  51.86 
 
 
302 aa  285  7e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
302 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 
300 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 
300 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  48.77 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  52.79 
 
 
302 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 
294 aa  268  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  48.82 
 
 
302 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  52.54 
 
 
302 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  48.82 
 
 
315 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
294 aa  265  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  47.75 
 
 
308 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 
305 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
290 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
341 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 
290 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
300 aa  257  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
297 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
290 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 
302 aa  255  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 
319 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 
292 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
289 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  46.18 
 
 
289 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
291 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  48.01 
 
 
323 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  48.23 
 
 
352 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
297 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
290 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 
290 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  47.29 
 
 
321 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.25 
 
 
294 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
304 aa  248  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 
292 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  41.89 
 
 
296 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  43.7 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  42.72 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 
289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  41.5 
 
 
293 aa  242  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  42.29 
 
 
295 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 
292 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
293 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
293 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 
297 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  42.16 
 
 
296 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 
296 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  43.24 
 
 
296 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>