More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3658 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  62.45 
 
 
296 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  58.74 
 
 
297 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  58.6 
 
 
292 aa  353  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  57.29 
 
 
294 aa  351  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 
295 aa  341  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  57.35 
 
 
292 aa  335  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  53.98 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  53.63 
 
 
294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  51.76 
 
 
291 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  51.58 
 
 
290 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 
296 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 
296 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  53.62 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  52.81 
 
 
298 aa  311  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  51.23 
 
 
294 aa  301  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  52.19 
 
 
296 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  52.01 
 
 
294 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  49.29 
 
 
297 aa  292  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 
297 aa  291  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
297 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  46.48 
 
 
292 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  51.92 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 
302 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  51.85 
 
 
300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 
300 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  51.49 
 
 
300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  50.55 
 
 
302 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  51.14 
 
 
302 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 
315 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  48.44 
 
 
302 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  45.91 
 
 
296 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  47.17 
 
 
297 aa  258  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  45 
 
 
308 aa  255  7e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  45.56 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.04 
 
 
290 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
290 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
305 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 
295 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 
302 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 
295 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 
290 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  43.48 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  42.8 
 
 
294 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 
293 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  42.36 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  43.02 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 
321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  42.44 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  45.04 
 
 
323 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  43.02 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 
341 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  43.02 
 
 
300 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  43.02 
 
 
300 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  43.02 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.64 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  43.32 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  47.2 
 
 
325 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  41.45 
 
 
311 aa  239  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 
294 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 
302 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 
290 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 
298 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 
296 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
292 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
290 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
290 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  41.73 
 
 
298 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  41.37 
 
 
298 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  40.73 
 
 
297 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  42.39 
 
 
296 aa  236  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  40.57 
 
 
297 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  42.26 
 
 
301 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 
298 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  43.02 
 
 
296 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
287 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  41.07 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  41.51 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.8 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.8 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.64 
 
 
292 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
301 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>