More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7859 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  64.21 
 
 
321 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  61.46 
 
 
308 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  61.3 
 
 
341 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  63.32 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  59.47 
 
 
308 aa  328  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  59.12 
 
 
305 aa  328  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 
308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  62.59 
 
 
352 aa  325  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  62.84 
 
 
306 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  61.86 
 
 
298 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  60.28 
 
 
298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  56.79 
 
 
300 aa  298  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 
325 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  56.43 
 
 
302 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  55.75 
 
 
301 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
292 aa  295  8e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  55.8 
 
 
303 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  55 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  55 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
307 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  58.84 
 
 
308 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 
302 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  48.24 
 
 
290 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 
295 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  51.86 
 
 
302 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  49.67 
 
 
308 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
294 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  47.9 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  47.54 
 
 
291 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 
305 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
299 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 
314 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
299 aa  245  6e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 
292 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
292 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
302 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 
297 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 
297 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 
298 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
296 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  47.62 
 
 
309 aa  232  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
294 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  50.36 
 
 
306 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  43.55 
 
 
296 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
292 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  47.49 
 
 
303 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  42.14 
 
 
291 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 
296 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 
296 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 
295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
296 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  41.84 
 
 
289 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
315 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  41.13 
 
 
289 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  47.39 
 
 
302 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  41.13 
 
 
289 aa  216  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  41.13 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 
294 aa  212  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 
294 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 
290 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 
290 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 
290 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 
290 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 
292 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 
288 aa  203  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 
290 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  48.7 
 
 
302 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  47.39 
 
 
302 aa  202  9e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  45.39 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  38.43 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 
297 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 
302 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  37.94 
 
 
290 aa  199  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  43.36 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>