More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4273 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 
305 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  54.27 
 
 
306 aa  292  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  55.31 
 
 
308 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 
341 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 
308 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  56.04 
 
 
308 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  56.31 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 
325 aa  279  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 
300 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 
307 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 
298 aa  275  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  53.29 
 
 
303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  55.31 
 
 
302 aa  271  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  52.08 
 
 
303 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
352 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
308 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
308 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
308 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  50.89 
 
 
321 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  50.72 
 
 
308 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
314 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  47.62 
 
 
302 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
307 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  50.76 
 
 
309 aa  232  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
295 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
299 aa  215  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  49.19 
 
 
303 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 
290 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 
294 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 
306 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
305 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 
302 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 
297 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 
297 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
296 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 
294 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 
294 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 
296 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 
296 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 
291 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 
292 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
298 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 
292 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 
292 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 
296 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  41.97 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
294 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  40.36 
 
 
300 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 
292 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 
296 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 
300 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 
300 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 
295 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 
290 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  40.88 
 
 
302 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  43.07 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 
290 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 
315 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 
302 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  34.85 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  40.51 
 
 
293 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 
293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1729  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0274763  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  34.85 
 
 
289 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 
294 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  34.77 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 
296 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 
289 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  39.48 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>