More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2190 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 314 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  65.62 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  64.93 
 
 		 300 aa  371  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  63.89 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  63.89 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  63.54 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  63.89 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  61.46 
 
 		 341 aa  351  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  59.03 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  54.58 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  61.13 
 
 		 298 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  54.14 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  53.58 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 		 306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  53.45 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  52.43 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  53.5 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  55.76 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  48.83 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.48 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  42.29 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  42.75 
 
 		 294 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  43.87 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  40.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  41.43 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  42.5 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  41.35 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  41.35 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  40.98 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  38.08 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  44.89 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  40.2 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  37.98 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  40.2 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  36.92 
 
 		 292 aa  186  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  37.89 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  37.14 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  41.1 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  39.79 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  36.4 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>