More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3544 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
352 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  80.6 
 
 
321 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  71.03 
 
 
308 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 
323 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  66.21 
 
 
308 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  64.51 
 
 
325 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  65.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  65.05 
 
 
305 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  66.67 
 
 
306 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  63.29 
 
 
341 aa  347  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  64.34 
 
 
308 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  63.82 
 
 
298 aa  344  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  64.81 
 
 
308 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  62.94 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  58.1 
 
 
300 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  58.42 
 
 
307 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  55.89 
 
 
302 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  61.89 
 
 
298 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  56.42 
 
 
303 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  56.19 
 
 
303 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  56.19 
 
 
303 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  56.57 
 
 
303 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  54.74 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  53.71 
 
 
314 aa  282  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  52.61 
 
 
302 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  52.8 
 
 
292 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  52.26 
 
 
302 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 
302 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  51.63 
 
 
305 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
307 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
295 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  48.23 
 
 
296 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 
297 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  47.86 
 
 
290 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
291 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 
294 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 
291 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  46.43 
 
 
294 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 
294 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
296 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  50.55 
 
 
302 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 
296 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  43.97 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
294 aa  232  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  51.36 
 
 
298 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  44.06 
 
 
296 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
292 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 
297 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 
294 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
295 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
302 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 
315 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
296 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
296 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 
297 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
298 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 
306 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  42.41 
 
 
297 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 
303 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 
296 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  48.31 
 
 
302 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  39.72 
 
 
292 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 
302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  42.35 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  43.92 
 
 
302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  43.7 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 
290 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 
290 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 
290 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 
296 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
290 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0646  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 
309 aa  205  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  42.59 
 
 
300 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  42.35 
 
 
300 aa  203  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  41.28 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  42.22 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  42.22 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 
290 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 
290 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 
295 aa  199  7e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  36.49 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 
289 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
297 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  36.79 
 
 
289 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 
291 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>