More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2241 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
307 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  68.49 
 
 
341 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  63.97 
 
 
298 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  60.61 
 
 
305 aa  332  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  58.48 
 
 
302 aa  328  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  57.97 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  54.58 
 
 
314 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
300 aa  322  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  59.3 
 
 
303 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  59.3 
 
 
303 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  59.3 
 
 
303 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  58.64 
 
 
321 aa  318  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  58.59 
 
 
308 aa  315  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  56.36 
 
 
301 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  59.59 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  58.42 
 
 
352 aa  299  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  59.23 
 
 
308 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  54.67 
 
 
323 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  58.19 
 
 
308 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  58.74 
 
 
308 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
308 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  52.36 
 
 
308 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  51.68 
 
 
302 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  52.58 
 
 
299 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
302 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  47.28 
 
 
295 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  47.49 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  52.82 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 
291 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 
292 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
299 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 
309 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
290 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 
296 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
294 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  47.85 
 
 
305 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 
298 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 
301 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
294 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  50.81 
 
 
303 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 
296 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 
291 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 
292 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 
296 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  48.61 
 
 
298 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 
292 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 
295 aa  205  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  37.84 
 
 
296 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  37.84 
 
 
296 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 
296 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 
297 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 
294 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 
292 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 
294 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  43.69 
 
 
302 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 
302 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 
315 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  45.62 
 
 
302 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 
297 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  36.71 
 
 
288 aa  193  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  36.82 
 
 
296 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 
291 aa  192  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 
291 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  40.78 
 
 
294 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 
302 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 
300 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
297 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  40.35 
 
 
300 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  41.82 
 
 
292 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 
291 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 
290 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  46.47 
 
 
302 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 
295 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  36.68 
 
 
297 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 
295 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 
290 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 
297 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 
289 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 
291 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 
290 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 
290 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>