More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  64.31 
 
 		 309 aa  348  8e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  61.92 
 
 		 306 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  64 
 
 		 303 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  56.42 
 
 		 308 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  53.16 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  54.45 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  51.51 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  52.94 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  53.9 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  52.36 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  53.24 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  54.17 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  52.54 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  52.2 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  54.3 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  55.74 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  49.67 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  53.11 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  48.67 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  50.16 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  45.27 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 291 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  40.68 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  40.68 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  41.33 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  40.82 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  44.49 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  38.03 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  43.44 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  37.67 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  37.97 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  47.66 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  48.5 
 
 		 206 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  43.03 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.04 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  42.62 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  42.63 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 		 294 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 290 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  35.96 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  41.98 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  44.14 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  38.19 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  38.31 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>