More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1847 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  66.21 
 
 
296 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  66.21 
 
 
296 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  69.66 
 
 
294 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  63.1 
 
 
294 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 
296 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 
294 aa  384  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  61.38 
 
 
296 aa  384  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  62.89 
 
 
302 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  57.84 
 
 
294 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 
295 aa  348  5e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  60.41 
 
 
302 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  60.07 
 
 
315 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  59.03 
 
 
300 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  58.76 
 
 
302 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  64.38 
 
 
302 aa  339  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 
302 aa  338  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  57.64 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  57.64 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  54.14 
 
 
292 aa  333  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  63.23 
 
 
302 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  53.1 
 
 
294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  53.62 
 
 
291 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
292 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  51.37 
 
 
297 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  51.71 
 
 
297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
296 aa  290  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 
308 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 
292 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
305 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 
295 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
297 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 
290 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  48.35 
 
 
291 aa  256  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  48.47 
 
 
321 aa  254  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 
290 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 
290 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 
341 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 
290 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 
294 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 
290 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 
290 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 
302 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  48.75 
 
 
308 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
295 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 
306 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
293 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 
308 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
291 aa  244  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 
295 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 
309 aa  242  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  48.92 
 
 
308 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  48.43 
 
 
308 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  46.13 
 
 
300 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
325 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
292 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 
291 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
292 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 
314 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  41.95 
 
 
297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 
307 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
352 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
319 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  41.32 
 
 
294 aa  238  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 
292 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 
292 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
292 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  47.79 
 
 
296 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 
293 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 
293 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 
296 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 
291 aa  235  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  43.71 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  44.06 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  40.35 
 
 
297 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  43.01 
 
 
296 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  41.96 
 
 
298 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>