More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5807 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  74.04 
 
 		 341 aa  427  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  63.97 
 
 		 307 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  63.83 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  63.76 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  63.07 
 
 		 302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  63.83 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  63.48 
 
 		 303 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  63.48 
 
 		 303 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  61.3 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  61.13 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  59.22 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  60.28 
 
 		 308 aa  324  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  59.17 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  59.39 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  62.41 
 
 		 298 aa  321  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  61.13 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  61.89 
 
 		 352 aa  318  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  59.52 
 
 		 308 aa  315  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  59.04 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  59.15 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  56.27 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 325 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  55.74 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  53.63 
 
 		 302 aa  281  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  56.31 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  51.76 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  56.06 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  51.88 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  52.25 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  45.42 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  46.1 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  44.57 
 
 		 292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  45.29 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  44.32 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  41.22 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  41.72 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  40.22 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  39.35 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  45.74 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 288 aa  202  7e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  43.77 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  43.12 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  42.39 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  42.2 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  42.2 
 
 		 315 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  42.75 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  38.93 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  34.41 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  46.27 
 
 		 206 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.29 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  36.71 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  38.21 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  38.93 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  37.96 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  36.07 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>