More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12766 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  597  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  80 
 
 
302 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  78.33 
 
 
303 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  78.04 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  78.04 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  78.04 
 
 
303 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  64.93 
 
 
314 aa  371  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  62.37 
 
 
341 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  62.15 
 
 
301 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  63.83 
 
 
298 aa  349  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  55.33 
 
 
307 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 
305 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 
308 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  57.84 
 
 
352 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 
302 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  58.39 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  56.79 
 
 
308 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  56.79 
 
 
308 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  58.68 
 
 
298 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
321 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  55.24 
 
 
308 aa  288  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  53.95 
 
 
308 aa  285  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  52.78 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1479  dihydrodipicolinate synthase  55.96 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205213  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
302 aa  281  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 
308 aa  278  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  52.76 
 
 
307 aa  275  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 
305 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  50.69 
 
 
325 aa  269  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
302 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  48.29 
 
 
295 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4273  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 
299 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  42.72 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  46.13 
 
 
299 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
309 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 
292 aa  238  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
294 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 
294 aa  233  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
291 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  41.88 
 
 
290 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 
306 aa  232  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 
292 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 
292 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 
294 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  43.45 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  43.48 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  40.58 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2315  dihydrodipicolinate synthase  48.3 
 
 
298 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
296 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
296 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 
296 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  43.22 
 
 
297 aa  215  8e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  42.49 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1229  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  41.76 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 
297 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 
292 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
288 aa  206  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 
302 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 
300 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 
300 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  37.23 
 
 
295 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 
300 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 
302 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  43.12 
 
 
302 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
302 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 
300 aa  196  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0646  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 
309 aa  192  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  39.39 
 
 
290 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 
290 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  40.73 
 
 
311 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 
295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 
290 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 
290 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  35.89 
 
 
297 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 
292 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  38.69 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  46.5 
 
 
206 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  37.19 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>