More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1251 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
302 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  99.34 
 
 
315 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17791  dihydrodipicolinate synthetase  71.19 
 
 
302 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  72 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00721  dihydrodipicolinate synthase  71.57 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28982 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0068  dihydrodipicolinate synthase  71.33 
 
 
302 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1745  dihydrodipicolinate synthase  69.1 
 
 
300 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18621  dihydrodipicolinate synthase  69.1 
 
 
300 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.696996  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18431  dihydrodipicolinate synthase  68.75 
 
 
300 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  67.59 
 
 
302 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  60.41 
 
 
299 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
296 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  54.05 
 
 
296 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 
296 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 
294 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
294 aa  321  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 
294 aa  316  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 
295 aa  315  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 
296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 
297 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
294 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
292 aa  292  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  50.55 
 
 
291 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
292 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  48.82 
 
 
296 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  50.74 
 
 
297 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  51.11 
 
 
297 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 
291 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  50.37 
 
 
297 aa  279  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  46.53 
 
 
290 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  47.55 
 
 
298 aa  276  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
296 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 
292 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
321 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
308 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
290 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
290 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.62 
 
 
294 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
292 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 
308 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 
323 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 
308 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  46.81 
 
 
305 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 
297 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  45.14 
 
 
308 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3544  dihydrodipicolinate synthase  46.04 
 
 
352 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.136616  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 
325 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 
292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 
292 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
290 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 
292 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
291 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  43.6 
 
 
293 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 
295 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 
292 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 
300 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 
290 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
290 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 
294 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 
291 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 
296 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 
290 aa  226  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.4 
 
 
291 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  46.64 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 
295 aa  225  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
300 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 
291 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 
291 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 
303 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 
297 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
289 aa  223  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 
295 aa  221  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07550  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 
300 aa  219  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.02513  normal  0.756847 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 
289 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  41.24 
 
 
292 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  40.42 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 
302 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 
296 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 
332 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>